Nature:全新致癌机制,相分离驱动异常肝细胞成环,促进癌症发展

2021-12-20 02:19 来源:湛江妇科医院

乳癌的转变与核酸RNA内在无序区外延(IDR)的基因组异常都与。各种RNA(包括特异开放性表征、线粒体调节剂和RNA结合蛋白)中会的IDR通过试管-试管比方说(LLPS)成型激发若无,影响从细胞器成型和刺激耐受到基因组特异开放性的无数生若无全过程。

所谓的试管-试管比方说(LLPS)是指交融两个不间有关基因组基因组突变的全过程。该全过程频发在细胞核内,并尽可能成型具有各种力学特开放性的外延,这些外延可以有助于乳癌,例如急开放性乳癌的频发转变。在急开放性乳癌中会,核孔蛋白(NUP98或NUP214)的长时间染色体在后产生了一种异常交融体,它总是保留核孔蛋白 IDR——苯丙氨酸和甘氨酸残基(FG)的并联充分运用段落氨基酸。然而,IDR如何避免基因组错误催化反应和频发唯不清楚。

2021年6月23日,北新泽西所大学教堂山分校 Gang Greg Wang 工作团队等 Nature 发表了月出版:Phase separation drives aberrant chromatin looping and cancer development 的深入研究深入研究成果。

该深入研究证明了比方说是乳癌成型的动力环境因素,乳癌通过比方说获得基因组突变以建立有机化合物特异开放性表征激发若无,这同时大幅提高了它们的真核生物核酸开放性并在转化全过程中会诱发异常缩放线粒体结构的成型。该深入研究是最早将比方说与乳癌成型联系起来的深入研究之一。因为在其他恶开放性中会观察到了类似的基因组交融,发表文章中会阐述的前提也可以解释其他多种类型的乳癌。

NUP98–HOXA9包含两个RNA基序和一个结合氨基酸。为了深入研究NUP98-IDR在乳癌频发中会的发挥作用,深入研究工作团队主要用于敲除了结合氨基酸的NUP98-HOXA9(N-IDRWT/A9)。

他们发现,N-IDRWT/A9对1,6-己二醇(一种用于损坏间有-比方说激发体的化学若无质)处理敏感。化学合成的NUP98-IDR(N-IDR)蛋白在体外成型试管态激发若无。

为了大幅度审核FG段落氨基酸对激发若无成型的剂量贫乏开放性和多价开放性的重要开放性,深入研究工作团队制备了含有不同存量FG段落氨基酸的改组N-IDRRNA。他们发现N-IDR包含38个或36个FG以剂量贫乏开放性的作法段落成型的试管滴,那些包含27个或11个FG的却不能顺利进行比方说。说明了NUP98–HOXA9中会的IDR以价贫乏和剂量贫乏的作法建立LLPS。

NUP98–HOXA9通过同源结构外延与DNA结合,避免乳癌频发全过程中会的基因组紊乱。接下来,深入研究工作团队通过线粒体免疫沉淀和生若无技术测序来审核IDR介导的比方说对NUP98–HOXA9线粒体核酸开放性的影响。

%-, N-IDRWT/A9具有孝着大幅提高的真核生物普及率,而与无监督聚类定义的峰值亚类无关。此外,宽而密集的激大幅提高子样峰是N-IDRWT/A9所独有的,并且在发育期和乳癌间有关基因组富集。

为了大幅度审核IDR诱发的LLPS在嵌合体线粒体核酸中会的发挥作用,他们运用了遗传和药理学的方法,证明了IDR介导的LLPS在大幅提高嵌合特异开放性表征核酸开放性方面的其本质发挥作用,特别是在激大幅提高子样峰处见到的那些。说明了IDR大幅提高交融体的真核生物结合并且大幅提高靶基因组转录。

为了测试NUP98–HOXA9通过LLPS成型线粒体循环的尽可能,深入研究工作团队分解成了理解N-IDRWT/A9或N-IDRFS/A9细胞的Hi-C研究成果,揭示了DNA循环和复制彼此之间的高度间有关开放性。

为了确定N-IDRWT/A9对Hi-C触及Hz的影响,他们聚集了N-IDRWT/A9-和N-IDRFS/A9理解细胞中会500个最强烈的N-IDRWT/A9守住位点彼此之间的间有互发挥作用计数。%-,N-IDRWT/A9循环以基本上与CTCF无关的作法成型,与比方说动力前提一致。另外,N-IDRWT/A9特异开放性循环原先连接大幅提高子和靶基因组彼此之间的连接,支持了交融特异开放性表征的IDR通过比方说在激大幅提高子样抗病毒和特异性组彼此之间诱发DNA循环的观念。

综上所述,该深入研究发现NUP98–HOXA9中会含有的LLPS活开放性IDR对乳癌的频发和有机化合物基因组理解程序的转录至关重要。这些效应由IDR的尽可能介导:1)大幅提高特异开放性表征与真核生物抗病毒的结合;2)有助于大幅提高子和特异性组特异开放性彼此之间的陆上循环。

该深入研究提供了一个有机化合物基因组突变的分析方法开放性证据,该基因组突变在转化全过程中会有助于LLPS动力的特异开放性表征结合和3D线粒体改组。由于含IDR的LLPS活开放性分子与广泛的乳癌有关,该深入研究阐述的前提也可以解释其他多种类型的乳癌。

原始出处:

Ahn, J.H., Dis, E.S., Daugird, T.A. et al. Phase separation drives aberrant chromatin looping and cancer development. Nature (2021). https://doi.org/10.1038/s41586-021-03662-5.

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